Согласно Академическому рейтингу университетов мира (Academic Ranking of World Universities) за 2016 год, определяющему 500 лучших высших учебных заведений мира, Тартуский университет вошел в группу учебных заведений, занимающих строчку в промежутке с 401 по 500, передает портал ERR.
Однако при внесении эстонского вуза в список была допущена небольшая ошибка — Тартуский университет был отмечен флагом Эстонской советской социалистической республики (ЭССР), являвшимся официальным символом Эстонии до 8 мая 1990 года. Причины, по которым составители списка использовали этот флаг, пока остаются неизвестны.
Академический рейтинг университетов мира ежегодно составляется в институте высшего образования Шанхайского университета Цзяо Тун и определяет 500 лучших университетов мира.